В ООО «Южный научно-образовательный центр «Транспортная безопасность» предусмотрены следующие органы управления:
Высшим органом управления в Учреждении является Учредитель. Единоличным исполнительным органом Учреждения является Генеральный Директор, который осуществляет текущее руководство деятельностью Учреждения.
С полномочиями и порядком деятельности органов управления можно ознакомиться в Уставе Учреждения.
Структурные подразделения и филиалы в Учреждении не предусмотрены.